2020年3月19日 · 染色质免疫沉淀后测序(ChIP seq)是一种针对DNA结合蛋白、组蛋白修饰或核小体的全基因组分析技术。 由于二代测序技术的巨大进步，ChIP-seq比其最初版本ChIP-chip具有更高的分辨率、更低的噪声和更大的覆盖范围。

2022年3月23日 · 染色质免疫共沉淀 (Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。 想要获得理想的ChIP结果，选择适合的抗体固然很关键，ChIP 流程中所有步骤也很重要。 本文对ChIP实验之前的准备、获得理想ChIP结果步骤、ChIP的qPCR定量分析和ChIP案例分析进行总结，希望帮助到正在做ChIP实验和qPCR定量分析的您。 开始 ChIP 之前要考虑三件事. （1）为您的实验查找适合的抗体. （2）优化染色质剪切. （3）评估您的 ChIP …

所谓input 是指断裂后的基因组DNA，它需要与沉淀后的样品DNA一起经过逆转交联，DNA纯化，以及最后的PCR或其他方法检测，但是不进行免疫沉淀。 任何HA-tagged protein对染色质状态的影响都会在input中呈现出来。 如果是input chip-seq，结果中会不会有我们想要看到的真的位点呢？ 是有的，因为它就是整个基因组上被打断的未经特异性选择过的随机（理论上）片段。 如果用PCR来做的话，也同样可能在我们想看的位置看到条带，因为它有基因组上的所有位置。 …

染色体免疫共沉淀（Chromatinimmunoprecipitation，ChIP）是一种可在体内用来确定与某一特定蛋白结合或蛋白定位所在的特异性DNA序列的技术。 不好理解的话可以拆分成三部分： “染色质”就是由“组蛋白和DNA”组成的物质；“免疫”就是通过抗体和靶蛋白（抗原）特异性结合，这里指用商品化或自制抗体和染色质中组蛋白结合，形成复合物；“共沉淀”就是2-3种物质形成的复合物通过沉淀的方法来分离。 所以ChIP技术就是“利用染色质中组蛋白和外源抗体的特异性结合，将染色质 …

1、细胞计数后过夜培养至细胞贴壁，细胞数不少于1x107个。 2、于 细胞培养基 中加入浓度为37%的甲醛（不含甲醇），至其终浓度为1%，轻轻晃动，使液体均匀，于通风厨中室温孵育10min。 3、加入浓度为甘氨酸（10x），至其终浓度为1x，于通风厨中室温孵育5min，终止 交联反应。 4、通风厨中吸除培养基，用等体积预冷的PBS洗细胞两次。 5、加入预冷的PBS，刮下细胞，吸入1.5ml预冷的离心管中，3000rpm，5min离心去掉上清。 1、取少量细胞提取总蛋 …

2015年6月4日 · ChIP对照设置. 1.input：样本经过超声，但是没有进行ChIP，包含样本超声后总DNA，可以进行电泳，检测超声效果，同时，可以与最后ChIP样本进行比较，看ChIP的效率（如果用同一引物进行PCR，ChIP组和input组亮度差不多，说明ChIP效率高，基本上，样本中所有的 …

染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation,ChIP）是一种适用于在体内研究蛋白质与DNA相互作用的方法。 这项技术能够帮助研究者判断在细胞核中基因组的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰或转录因子结合…

2020年6月30日 · ChIP实验是通过抗体把DNA-Protein 的复合物沉淀下来，然后对与蛋白结合的 DNA 进行纯化， 随后，进一步对DNA 进行普通PCR, qPCR 或者测序等实验来分析结果。

两种常用的标准化 ChIP-qPCR 数据方法——Percent Input法和 富集倍数法 （Fold Enrichmen）。与input相关的ChIP-qPCR数据包括ChIP的背景水平和input染色质的标准化。建议ChIP 实验重复，尽可能将结果与背景信号和 标准误差 一起显示。 Percent Input法

2019年2月18日 · input是ChIP实验中的一种阳性对照，样品经过超声破碎后取出一部分作为input，input不进行ChIP实验，因而包含样本超声后释放的所有DNA、蛋白质。 首先，input可以帮助检测超声破碎的效果，以及目的蛋白在样品中的表达情况。